Внутренние аудиторы Министерства Финансов и руководители отделов Внутреннего аудита из Министерство Сельского Хозяйство, Министерство Образование, Министерство Труда и Социальной Защиты, Главное управление Финансов г. Душанбе в приняли участие во второй части программы обучения по применению системного подхода в исполнении аудиторского задания. Обучение проводилось в рамках Проекта Еврокомиссии по Поддержке процесса укрепления потенциала по управлению Государственными Финансами в Таджикистане.
Во время обучения внутренние аудиторы определяли вид аудита, цели и охват аудиторского задания, делали предварительную оценку риска в своей бюджетной организации, разрабатывали тесты для проверки надежности мероприятий по внутреннему контролю. С помощью этих тестов можно установить насколько эффективны меры и процедуры, созданные руководством бюджетного учреждения для предотвращения ущербов, нецелевого использование средства и соблюдения законодательства РТ. Внутренние аудиторы также занимались дизайном тестов по существу, которые дают возможность установить полной размер ошибок в финансовых отчетах, если такие были допущены. Детально были рассмотрены две программы для внутреннего аудита: Аудит расходов по заработной плате и других персональных расходов и Аудит кассовых и банковских операций. Эти программы являются частью новой методологии по внутреннему аудиту, которая разработана в рамках проекта Еврокомиссии.